Экзотические растения в Аджарию начал завозить один из первых садовников в Грузии Михаил Д’Альфонс еще в 1881 году; он разбил сад неподалеку от Чакви. Затем в 1892 году географ и путешественник-ботаник Павел Татаринов на батумском побережье устроил т.н. «климатизационный сад», который в настоящее время является частью Батумского ботанического сада и носит название «Верхний парк».
В 1912 году по инициативе профессора Харьковского университета Андрея Краснова был открыт сам Ботанический сад, который расположен в 9 километрах от центра Батуми между зеленым мысом и притоком реки Чаквистави. Сад занимает примерно 1 километр прибрежной зоны и простирается вверх по холму на высоту от 0 до 220 метров над уровнем моря.
Некогда эта территория была занята лесом колхидского типа, на верхнем ярусе которого преобладали буки, каштаны, липы, и в нижнем подлеске – лавровишни и рододендроны.
Среди 2037 древесных видов 104 имеют кавказское происхождение, а 1504 вида – привезенные из-за границы. Растения в саду распределены по местам происхождения в 9 фито-географических отделах: австралийском, новозеландском, восточно-азиатском, гималайском, североамериканском, мексиканском, южноамериканском, средиземноморском и кавказском субтропических отделах.
С 1998 года Батумский ботанический сад является членом Международного совета ботанических садов по охране растений (BGCI) и непосредственно сотрудничает с ботаническими садами, университетами и научно-исследовательскими учреждениями в более чем 140 странах.